目前突触蛋白常作为突触功能障碍和丧失的生物标志物进行研究，突触功能障碍和丧失是阿尔茨海默病（AD）的重要神经病理学特征，且与认知衰退程度密切相关。在这项研究中，研究者专门研究了突触结合伴侣轴突蛋白（NR×N）和神经连接蛋白（NIgn），以评估其生物标志物的潜力。

对照、由AD引起的轻度认知障碍（MCI）、由其他病症引起的MCI、AD患者和一组非AD痴呆患者的脑脊液（CFS）样本

对选中的31种膜蛋白酶NR×N和Nlgn肽进行进一步筛选，并通过PRM在不同患者和对照组中进行定量分析，以确定是否适合作为AD生物标志物。

1.筛选多肽

共在CSF样品中研究了31种胰蛋白酶NRXN和Nlgn肽，因15种肽无法定量，最终使用16种肽（NRXNs为10种，Nlgns为6种）用于临床队列中的组间比较和最终分析。将表现效果不好的多肽（特别是存在于Nlgns中的），排除在进一步的分析中。

2.验证靶向蛋白panel

在临床队列中进行靶蛋白的检测，包括来自对照（n=22）的CSF，由AD引起的轻度认知障碍（MCI) （n=44) ，由其他病症引起的MCI （n=46) , AD （n=77）和一组非AD痴呆（n=28) ，结果显示，在AD（痴呆和MCI阶段）、对照、非AD痴呆组之间未发现NR×Ns和NlgnS水平差异（图1）。

3.NRXN和Nlgn蛋白的相关性

除少数例外，在所有组中都发现NR×N和Nlgn蛋白之间有很强的相关性（图2)，但与AD核心生物标志物和突触生物标志物神经粒蛋白和生长相关蛋白43的相关性很弱，可能反映了突触的不同致病过程。

Elena Camporesi, Johanna Nilsson, Agathe Vrillon, et al. Quantification of the trans-synaptic partners neurexin-neuroligin in CSF of neurodegenera- tive diseases by parallel reaction monitoring mass spectrometry. EBioMedicine. 2022 Jan;75: 103793. doi: 10.1016/j.ebiom.2021.103793. Epub 2022 Jan 3.

研究者发现两种尿液糖蛋白，前列腺酸性磷酸酶（ACPP）和聚集素（CLU）联合血清前列腺特异性抗原（PSA）可作为基于定量糖蛋白组学检测侵袭性前列腺癌（PCa）的三种标记panel。为促进将候选标志物转化为临床可应用的检测，本研究开发了可广泛应用于多个实验室、稳定且可靠的靶向平行反应监测（PRM）检测方法。

195例进展性前列腺癌患者的尿液

使用自动化高通量平台处理尿液样本以分离ACPP和CLU的两种糖肽。针对两种候选糖肽开发了PRM测定法并评估该方法的分析性能。通过PRM检测对尿液样品中富集的糖肽进行靶向定量LC-MS/MS分析。最后，对靶向糖肽的相对定量结果进行统计学分析，评估PRM检测与血清PSA组合区分侵袭性PCa的临床表现。

1.PRM分析法建立和表征

成功建立了尿液ACPP末日CLU糖肽的PRM测定法，该方法具有良好的重复性和足够的工作范围，可覆盖三到四个数量级（图1 ）。

2.对个体尿液样本进行本研究开发的PRM检测)

在142份尿液使用该方法进行检测，结果发现，该方法在142份尿液样本中均可定量到两种糖肽，而且结果稳定、准确。

3. 评估PRM法在检测侵袭性PCa中的表现

相对于非侵袭性PCa，来自ACPP的糖肽表达谱在侵袭性PCa中显著降低（p值＜0.01）。相比之下，来自CLU的糖肽在侵袭性PCa组中, 显示更高的表达水平（p值＜0.05）。再经过整合分析后发现，PRM检测尿糖肽的方法，适用于实际临床标本中靶向肽的定量分析，可辅助血清PSA检测以获得更好的鉴别能力（图2）。

Mingming Dong, Tung-Shing Mamie Lih, Naseruddin Hoti, et al. Development of Parallel Reaction Monitoring Assays for the Detection of Aggressive Prostate Cancer Using Urinary Glycoproteins.J Proteome Res.2021 Jul2;20(7):3590-3599.doi: 10.1021/acs.jproteome.1c00162. Epub 2021 Jun 9.